Создание международной платформы ComputAge для оценки биологического возраста

Исследователи AIRI и Сколтеха создали первую в мире открытую платформу для объективного сравнения алгоритмов определения биологического возраста человека так называемых часов старения Работа объединила крупнейший в мире открытый набор данных по метилированию ДНК и стандартизированную методологию оценки что впервые позволило системно сравнить разные модели для которых раньше не было единого эталона В исследовании были протестированы 13 ведущих моделей часов старения на основе унифицированного набора из более чем 17 000 образцов По итогам сравнения лучшей была признана модель PhenoAge второго поколения созданная под руководством Морган Левин Йельский университет второе место заняла разработка GrimAge Стив Хорват Калифорнийский университет Биологические часы имеют широкую практическую ценность Они могут использоваться для оценки эффективности антивозрастных препаратов кластеризации пациентов по рискам заболеваний мониторинга здоровья в клинических исследованиях а также встраиваются в носимые устройства для расчета индекса здоровья Платформа и собранный массив данных с открытой лицензией Creative Commons Это позволяет исследователям со всего мира свободно использовать проверять и совершенствовать инструменты для подсчета биологического возраста Подробнее читайте в материале Компьютерры Научная статья GitHub Hugging Face Йельский университет США организация деятельность которой признана нежелательной на территории России

В AIRI и Сколтехе представили платформу ComputAge для сравнения ML моделей определения биологического возраста Платформа объединяет открытый набор данных по метилированию ДНК стандартизированную методологию оценки и результаты тестирования моделей Биологический возраст это интегральная метрика здоровья человека Его можно определить с помощью моделей машинного обучения на основе данных анализов крови эпигенетики транскриптомики и других источников Набор данных ComputAge включает больше 17 тыс образцов метилирования ДНК из 104 исследований Они охватывают 19 предполагаемых состояний которые ускоряют старение На базе этих данных была создана основа для систематической оценки алгоритмов Исследователи протестировали 13 ML моделей определения биологического возраста Лучшими были признаны PhenoAge и GrimAge разработанные в Йельском и Калифорнийском университетах США ComputAge на GitHub ComputAge Bench Dataset на Hugging Face Источник airi net ru blog sverili chasy uchenye vpervye sravnili instrumenty po podschetu biologicheskogo vozrasta cheloveka

Исследователи из AIRI и Сколтеха создали уникальную международную платформу предназначенную для независимой проверки эффективности методов определения биологического возраста часов старения Проект включает самый большой общедоступный массив данных о метилировании ДНК унифицированную систему анализа и итоги испытаний лучших мировых моделей в этой области

Команда исследователей AIRI и Сколтеха представила первую в мире открытую платформу для объективного сравнения алгоритмов выявления биологического возраста так называемых часов старения Они могут использоваться для оценки эффективности новых препаратов в омоложении организма например метформина или семаглутида кластеризации пациентов по рискам и мониторинга здоровья в клинических исследованиях а также изучения фундаментальных механизмов старения Биологический возраст это интегральная метрика здоровья человека которая может отличаться от паспортного возраста Если биологический возраст выше хронологического это указывает на повышенные риски заболеваний и смертности Сейчас такие метрики рассчитываются с помощью различных моделей основанных на данных эпигенетики транскриптомики анализов крови и других источников Однако до сих пор в науке не существовало единого эталона для их сравнения Авторы работы собрали более 17 000 образцов метилирования ДНК из 104 исследований охватывающих 19 предполагаемых состояний ускоряющих старение унифицировали данные и создали основу для систематической оценки алгоритмов В исследовании были протестированы 13 наиболее популярных моделей часов старения включая разработки ведущих лабораторий США и Европы Дмитрий Крюков руководитель группы исследования биомаркеров лаборатории Сильный ИИ в медицине Института AIRI младший научный сотрудник Центра молекулярной и клеточной биологии Сколтеха Теперь ученые и компании по всему миру могут объективно выбирать и улучшать алгоритмы а значит мы приблизились к тому чтобы биологический возраст стал реальным инструментом медицины будущего Узнать какая модель была признана лучшей а также найти код набор данных и ссылку на научную статью посвящённую разработке бенчмарка можно здесь